Dịch vụ kiểm toán qua cửa khẩu, biên giới là do các công ty, tổ chức kiểm toán ở nước ngoài thực hiện công việc kiểm toán cho các doanh nghiệp, tổ chức hoạt động, phát hành báo cáo kiểm toán tại Việt Nam. Các công ty, tổ chức kiểm toán nước ngoài không cần hiện diên pháp nhân, hay thể nhân tại Việt Nam
Theo Nghị định 17/2012/NĐ-CP quy định và hướng dẫn một số điều Luật Kiểm toán độc lập, trong đó bắt buộc một số các điều kiện về việc cung cấp dịch vụ kiểm toán qua biên giới đối với các doanh nghiệp kiểm toán nước ngoài như: Doanh nghiệp kiểm toán phải có vốn chủ sở hữu trên 500.000USD, mua bảo hiểm trách nhiệm nghề nghiệp cho kiểm toán viên hành nghề tại Việt Nam, ký quỹ tương đương vốn pháp định tại ngân hàng thương mại Việt Nam. Đồng thời, doanh nghiệp phải có văn bản của cơ quan quản lý hành nghề của nước đặt trụ sở chính xác nhận không vi phạm pháp luật trong 3 năm liền trước khi cung cấp dịch vụ kiểm toán qua biên giới và có 5 kiểm toán viên được Bộ Tài chính Việt Nam cấp giấy chứng nhận hành nghề kiểm toán, trong đó có người đại diện theo pháp luật.
Việc công nhận dịch vụ kiểm toán qua biên giới thực tế là sự đánh dấu cho sự ra đời một cách chính thức dịch vụ này theo đúng các cam kết mà Việt Nam đã ký với các tổ chức qua các hiệp định như: Hiệp định khung ASEAN (AFAS), Hiệp định thương mại song phương Việt Nam – Hoa Kỳ (BTA), Hiệp định chung về Thương mại dịch vụ của tổ chức WTO (GATS).
Các doanh nghiệp kiểm toán tại Việt Nam hiện nay chưa thể triển khai dịch vụ này ra nước ngoài bởi các văn bằng, chứng chỉ được đào tạo ở nước ta chưa được nước ngoài thừa nhận (trừ 4 công ty kiểm toán quốc tế có mặt tại Việt Nam).
Thạc sỹ Phan Thanh Hải – Đại học Duy Tân (Đà Nẵng) chia sẻ, dịch vụ kiểm toán qua biên giới được thừa nhận đang là một thách thức đối với các doanh nghiệp kiểm toán Việt Nam, dịch vụ kế toán thuế trọn gói, bởi việc cung cấp dịch vụ kiểm toán qua biên giới đòi hỏi các doanh nghiệp kiểm toán phải có những hiểu biết sâu rộng về văn hóa kinh doanh, truyền thống của các quốc gia khác nhau, đặc biệt là hệ thống pháp luật quốc tế. Điều này các doanh nghiệp kiểm toán ở nước ta còn rất hạn chế.
Theo ông Hải, cần có những cuộc hội thảo khoa học để nhìn nhận đánh giá một cách đầy đủ những ưu điểm, hạn chế cũng như những cơ hội và thách thức của ngành kiểm toán độc lập trước bối cảnh hội nhập sâu rộng về dịch vụ kiểm toán trên thị trường quốc tế. Đồng thời, phải làm lại các khâu: Hoàn thiện các văn bản pháp luật hướng dẫn về hành nghề kiểm toán cho phù hợp với các quy định chuẩn mực kiểm toán quốc tế. Mặt khác, cần cải cách quy trình đào tạo, cấp các bằng cấp chứng chỉ hành nghề liên quan đến kiểm toán theo định hướng tiến đến công nhận các bằng cấp và văn bản lẫn nhau giữa Việt Nam với các quốc gia trên thế giới.